二月23

这是郝事之秋陪你的第天！

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GenomeofTripterygiumwilfordiiandidentificationofcytochromePinvolvedintriptolidebiosynthesis

Firstauthor:LichanTu;Affiliations:CapitalMedicalUniversity(首都医科大学):Beijing,China

Correspondingauthor:WeiGao

TriptolideisatracenaturalproductofTripterygiumwilfordii.Ithasantitumoractivities,particularlyagainstpancreaticcancercells.Identificationofgenesandelucidationofthebiosyntheticpathwayleadingtotriptolidearetheprerequisiteforheterologousbioproduction.Here,wereportareference-gradegenomeofT.wilfordiiwithacontigN50of4.36?Mb.Weshowthatcopynumbersoftriptolidebiosyntheticpathwaygenesareimpactedbyarecentwhole-genometriplicationevent.Wefurtherintegrategenomic,transcriptomic,andmetabolomicdatatomapagene-to-metabolitenetwork.ThisleadstotheidentificationofacytochromeP(CYPB70)thatcancatalyzeoxidationofamethyltotheacidmoietyofdehydroabieticacidintriptolidebiosynthesis.Wethinkthegenomicresourceandthecandidategenesreportedheresetthefoundationtofullyrevealtriptolidebiosyntheticpathwayandconsequentlytheheterologousbioproduction.

雷公藤甲素是雷公藤的一种微量天然产物。雷公藤甲素具有抗肿瘤活性，尤其是针对胰腺癌细胞。鉴定雷公藤甲素生物合成相关基因及通路是异源生物合成的先决条件。本文中，作者报道了雷公藤的参考级别基因组，contigN50长4.36?Mb。作者发现雷公藤甲素生物合成通路基因的拷贝数目受到近期的一次全基因组三倍化事件的影响。作者进一步通过整合基因组、转录组以及代谢组的数据构建了一个基因-代谢物网络。通过以上的分析，作者鉴定到了一个细胞色素P蛋白CYPB70在雷公藤甲素生物合成过程中催化脱氢松香酸上的一个甲基氧化形成羧基。本文的所提供的雷公藤基因组资源以及鉴定的雷公藤甲素合成候选基因为充分理解雷公藤甲素的生物合成途径和以及异源生物生产奠定了基础。

通讯：高伟(