《名侦探柯南》中的黑衣组织是一个神秘而恐怖的组织，但凡知道组织秘密的人都会被杀死，甚至还会牵连周边的人。少年侦探工藤新一因为偷看到黑衣组织成员的非法交易被强行灌下了毒药APTX，但在细胞自我破坏的偶发性情况下，工藤新一死里逃生变成了7岁孩童的模样，并化名为江户川柯南。为了不让黑衣组织的人知道自己还在人世，柯南一直都在隐匿行踪，尽管十分谨慎，可还是有不少组织成员知道了他的真实身份，他们都是谁呢？

01雪莉

雪莉是黑衣组织中的顶级科学家，毒药APTX就是她研发出来并提供给组织的。

在某一天，雪莉同往常一样进入实验室进行工作，突然发现用于做药物实验的小白鼠居然变小了，大吃一惊的雪莉没有向组织上报这件事，而此时关于琴酒毒杀了高中生侦探的事情传到了她的实验室。

接到组织命令，雪莉和她的同事需要去工藤新一家中核实他的死亡，第一次雪莉一行人并没有什么发现，第二次去的时候，雪莉惊讶地发现一月前还在柜子里工藤新一儿童时期的衣服全都不见了，联想到那只小白鼠，雪莉猜想工藤新一并没有死亡而是变成了孩童。

后来雪莉背叛组织逃了出来，被阿笠博士捡到后，从他的口里得知了工藤新一如今的身份，帝丹小学一年级B班的江户川柯南。

02贝尔摩德

贝尔摩德似乎一出场就知道柯南就是工藤新一，因为贝尔摩德的真实身份莎朗·温亚德是新一母亲有希子的好朋友，曾在有希子处见过新一年幼时的照片，因此对于与幼年新一如此相似的柯南心存疑虑，联想起自己身上的特殊情况，对此更加怀疑。

贝尔摩德在执行雪莉回收行动时，曾装扮成新出医生一段时间，并从警署中偷走了与毛利小五郎有关的所有卷宗，逐渐证实了心中猜想。

为了抓住雪莉，贝尔摩德还在阿笠博士家装了窃听器，偷听了柯南他们的对话，完全肯定了江户川柯南就是工藤新一。

03爱尔兰威士忌

爱尔兰威士忌是黑衣组织潜入警视厅的卧底，曾注意到江户川柯南居然在追踪易容成警官的贝尔摩德，便对柯南起了疑心，开始调查他的身份。

爱尔兰威士忌借助自己新身份的便利在警视厅资料库中查找江户川柯南的资料，随后他又在另一次搜查会议上意外得到了一些关于工藤新一曾在帝丹高中学园祭出现的信息，察觉到了些许不对劲，猜想二者间可能有什么联系。

于是，爱尔兰威士忌在当晚分别潜入帝丹高中与帝丹小学，将黑衣骑士头盔上工藤新一的指纹与美工课作品上柯南的指纹进行比对，发现结果一致，意识到了柯南和新一为同一个人。

04宫野明美

宫野明美是黑衣组织的底层人员，雪莉的姐姐。她曾经想要带着妹妹一起脱离组织，被迫接受组织布置的抢劫十亿日元的任务。

在完成任务的过程中，她结识了江户川柯南，讶异于他拥有超越年龄的成熟冷静和精明头脑。

在完成任务要求组织兑现承诺时，可琴酒他们却出尔反尔，结果宫野明美遭到了琴酒他们的反杀。根据蛛丝马迹找到线索跟来的柯南见到了宫野明美最后一面，宫野明美临死前问了柯南的真实身份，柯南告诉她：我叫工藤新一！

05黑麦威士忌

黑麦威士忌就是赤井秀一，十年前曾在海边见过年幼的新一。

在与柯南的多次合作中，赤井就非常怀疑柯南的身份，但柯南的嘴巴太严实了，根本问不出所以然来。

在赤井假死化名为冲矢昴后，柯南邀请他住在工藤家，此时的赤井已经猜测出江户川柯南就是工藤新一了。

赤井为了证实自己的猜测，在一次案件中他请小兰给新一打电话寻求解决办法，然后他躲在暗处悄悄